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Annotatie : Afin d'apporter des outils d'aide à la gestion des races canines en France, cette étude cherche à analyser la structure génétique de l'espèce ainsi que les pratiques d'élevage sous-jacentes. Trois approches ont été employées afin de caractériser cette structure : des données d'enquêtes, des analyses de généalogies ainsi que l'utilisation des marqueurs moléculaires. Sur la base de 985 questionnaires remplis par des éleveurs de chiens, tant amateurs que professionnels, il a été possible de mettre en évidence des différences claires sur les pratiques en fonction des races élevées, ou du degré d'implication des éleveurs dans leur activité. Les analyses des données généalogiques de 61 races ont permis de confirmer cette hétérogénéité de pratiques et de situations en terme de variabilité génétique, avec certaines des populations montrant des évolutions de consanguinité préoccupantes. A partir de génotypages réalisés sur un échantillonnage de 1514 animaux appartenant aux 61 races, les résultats obtenus divergeaient parfois des données généalogiques. Cependant ces divergences pouvaient en partie être expliquées par les différences théoriques existantes entre les deux approches. A l'échelle individuelle cependant, les corrélations entre parenté généalogique et similarité moléculaire étaient significatives pour les échantillons étudiés, et similaire à celles qui pouvaient être obtenues à partir de simulations. L'analyse des relations génétiques entre les populations a permis de confirmer que les races constituaient bien des structures génétiques homogènes. En effet, jusqu'à 93,3% des individus étaient correctement affectés au sein de leur race. Ce dernier résultat permet d'envisager des applications pratiques en terme de gestion des races.

Annotatie : Programmes d'élevage internationaux pour améliorer la santé des chiens de race. La question du bien-être et de la santé des races canine est devenue une préoccupation croissante du public et des acteurs de la cynophilie. De ce fait, la mise en oeuvre de programmes de sélection visant à réduire l'incidence des maladies héréditaires leur impact sur le bien-être devraient être une priorité pour les éleveurs de chiens et les organisations raciales et nationales. Dans cette perspective, il est important de prendre en compte la dimension internationale qui existe dans la sélection des races canines, notamment vis-à-vis des échanges de reproducteurs. L'objectif de cette thèse était d'étudier les stratégies de gestion pour améliorer la santé des races dans un contexte international, concernant à la fois l'évaluation génétique et la gestion de la variabilité génétique. Une enquête a été lancée auprès des organisations canines nationales, 15 pays ayant répondu à celle-ci, dont 11 en Europe. Les affections héréditaires, la question des hypertypes ainsi que la consanguinité et diversité génétique ont été classés comme les enjeux les plus préoccupants. Une analyse généalogique a été mise en place à partir des données fournies par trois organisations nationales, le Kennel Club (Royaume Uni), la Société Centrale Canine (France), et le Svenska Kennelklubben (Suède). Sur la base des généalogies fournies pour les Labrador et golden retriever, une analyse a été effectuée pour étudier la faisabilité d'évaluations conjointes entre les pays pour dysplasie de la hanche. Finalement, le potentiel d'amélioration génétique pour un caractère complexe en fonction de différentes stratégies (sélection phénotypique, évaluation génétique, échange de reproducteurs entre pays) a été testé à partir de simulations. À ce titre, les bénéfices de l'échange d'animaux reproducteurs entre les pays sont clairement démontrés par les études, ces échanges permettant d'augmenter les variabilités génétiques et d'améliorer le progrès génétique, en particulier pour les petites populations canines.