Résumé : "Le chien de protection est l'un des acteurs des systèmes d'élevage actuels et sa présence apporte à la fois protection et problématiques dans le cadre du partage des espaces. L'intégration de la considération du bien-être animal est par ailleurs nécessaire. Afin de prendre en compte ces problématiques, le ministère de l'Agriculture a missionné divers acteurs dans la structuration d'une filière nationale. En l'absence de réglementation spécifique au chien de travail et plus spécifiquement au chien de protection, la rédaction d'un guide de bonne pratique est encouragée, ce qui fait l'objet de cette thèse. L'objectif de cette thèse a été dans un premier temps de faire un état des lieux du contexte et des spécificités du chien de protection des troupeaux en France, ainsi que de faire la synthèse de la réglementation pouvant s'appliquer à son utilisation et son élevage. Dans un second temps, l'objectif a été de mettre en évidence, à l'aide d'avis d'experts puis d'un questionnaire en ligne à destination d'utilisateurs de chiens de protection, des points critiques d'atteinte du bien-être des chiens de protection. Les points critiques mis en évidence concernaient les choix en matière d'individus reproducteurs, les conditions de développement des chiots et leurs interactions avec l'humain, les spécificités de détention des chiens avec leur troupeau, les problèmes liés à la présence des chiens et les solutions mises en place ainsi que le devenir des chiens de protection âgés au sein du troupeau. Les 38 réponses au questionnaire ont permis d'attester de pratiques respectueuses du bien-être animal au sein des répondants. La taille de l'échantillon et les modalités de diffusion du questionnaire ne permet cependant pas de généraliser à l'ensemble des utilisateurs en France. La dernière partie propose une liste de solutions possibles pour assurer le bien-être de ces chiens tout en considérant au mieux les contraintes d'élevage. Cette dernière partie souligne l'importance du travail de sélection, de formation des utilisateurs et la nécessité d'un travail de familiarisation pour l'ensemble des chiens mis au troupeau, pour une meilleure cohabitation avec les autres usagers des territoires."