Résumé : "Parmi les millions d'animaux momifiés par les anciens égyptiens, le chien est l'un des plus représentés. L'Égyptologie et l'Archéozoologie, en étudiant respectivement les textes et les représentations d'une part, et les vestiges animaux d'autres part, ont donné de véritables clefs pour comprendre ce contexte chrono-culturel si particulier. L'objectif de la première partie de cette thèse est de donner au lecteur les principales connaissances utiles à l'étude du crâne (sans la mandibule) du chien en Égypte ancienne, en proposant une approche interdisciplinaire entre Sciences naturelles et Histoire, afin de mieux appréhender les relations Homme-chien dans ce contexte si particulier. La deuxième partie, expérimentale, consiste en l'étude d'environ 140 crânes de chiens momifiés adultes provenant des nécropoles E9, N22 et P5 du site d'El-Deir dans l'oasis de Kharga. Une étude morphologique et morphométrique est effectuée. Les particularités dentaires, les pathologies et des caractères qualitatifs cités dans la littérature pour la détermination du sexe sont étudiés. Morphométries classique et géométrique sont appliquées conjointement afin de tenter d'identifier morphotypes et sexes. Les critères utilisés sont préalablement testés sur une collection de référence constituée de chiens de races variées et de sexes connus, de période actuelle (collections au MNHN et du Muséum de Genève) ou issus d'un contexte archéologique voisin (chiens de Kerma). Les résultats obtenus suggèrent que les chiens d'El-Deir proviendraient au moins en partie d'un élevage confiné, propice à des conditions sanitaires médiocres et aux mauvais traitements. Les chiens sont de morphotypes variés avec une majorité de parias semblables aux chiens de Kerma. La possibilité d'une reproduction locale avec une forte consanguinité est avancée. Enfin, la validation croisée des méthodes utilisées pour la détermination du sexe sur des chiens de races variées incite à la prudence quant à l'utilisation de critères fréquemment utilisés en Archéozoologie."